Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms