Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PSMA1P25786 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms