Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DPA1P20036 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms