Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms