Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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