Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESR1P03372 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESR1P03372 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ESR1P03372 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms