Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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