Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms