Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms