Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms