Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms