Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AP001107.1-201ENST00000501708 2792 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 KNSTRN-216ENST00000608100 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 BAAT-202ENST00000395051 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 HSPB3-201ENST00000302005 784 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 SPATA6L-202ENST00000381890 1295 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AL160279.1-201ENST00000425861 721 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MEG8-205ENST00000442197 625 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 FLJ42102-202ENST00000460880 1116 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR762HG-202ENST00000565573 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 CFAP52-208ENST00000576499 711 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 PITPNC1-204ENST00000581322 1124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 PCGF7P-201ENST00000595406 1051 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC010636.1-201ENST00000598116 628 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AL158850.2-204ENST00000616537 1188 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 AC024475.4-201ENST00000635144 1206 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 TOM1L1-203ENST00000536554 1522 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-3Q9BYR6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms