Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD1Q9BUP0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms