Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CENPOQ9BU64 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms