Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms