Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms