Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9Q92623 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms