Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L4Q8WXT5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms