Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC4CQ8WTT0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms