Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP1Q8TDR0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms