Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms