Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms