Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SNAPC1Q16533 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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