Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PMCHL1Q16048 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PMCHL1Q16048 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL1Q16048 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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