Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP6AP1Q15904 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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