Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms