Protein–RNA interactions for Protein: Q15334

LLGL1, Lethal(2) giant larvae protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1Q15334 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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LLGL1Q15334 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LLGL1Q15334 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms