Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms