Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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GBX1Q14549 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GBX1Q14549 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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