Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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