Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PMS2P3Q13401 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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