Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPA4Q13156 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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