Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTP4A2Q12974 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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