Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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