Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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STX4Q12846 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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STX4Q12846 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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STX4Q12846 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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STX4Q12846 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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STX4Q12846 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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