Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TROQ12816 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TROQ12816 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TROQ12816 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TROQ12816 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TROQ12816 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TROQ12816 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TROQ12816 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TROQ12816 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TROQ12816 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms