Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms