Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK16Q00536 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms