Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms