Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms