Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms