Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL1P47992 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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XCL1P47992 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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XCL1P47992 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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XCL1P47992 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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XCL1P47992 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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XCL1P47992 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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XCL1P47992 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL1P47992 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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