Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MLH1P40692 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms