Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJC1P36383 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms