Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA3P32297 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms