Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP1P29466 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP1P29466 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP1P29466 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP1P29466 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP1P29466 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP1P29466 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP1P29466 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms