Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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