Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMPD1P23109 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms