Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms