Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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